要深入学习Java底层知识，需要掌握以下几个方面：

1. 计算机体系结构：掌握计算机的基本硬件结构，包括CPU、内存、磁盘、输入输出设备等。

2. 操作系统原理：掌握操作系统的基本原理，包括进程、线程、内存管理、文件系统等。

3. Java虚拟机（JVM）：掌握JVM的基本原理，包括类加载、内存模型、垃圾回收等。

4. Java语言特性：深入理解Java语言的特性，掌握其面向对象、异常处理、反射等特性。

5. Java并发编程：学习Java多线程的实现细节，掌握synchronized、volatile等关键字的使用，以及线程池、并发集合等技术的应用。

推荐学习资源：

1. 《深入理解Java虚拟机》

2. 《计算机组成原理》

3. 《操作系统概念》

4. 《Java并发编程实战》

5. 《Java编程思想》

除了以上资源，还可以通过参与开源项目、阅读Java源码等方式深入学习Java底层知识。