计算机网络安全措施主要包括保护网络安全、保护应用服务安全和保护系统安全三个方面。在保护网络安全方面，需要考虑物理安全、防火墙、信息安全、Web安全和媒体安全等措施，以确保系统间通信的机密性、完整性、认证性和访问控制性。保护应用安全则针对特定应用（如Web服务器、网络支付专用软件系统）建立安全防护措施，独立于网络的其他安全措施。保护系统安全则从整体系统的角度进行安全防护，涉及网络系统硬件平台、操作系统、各种应用软件等的安全性保障。这些措施都是为了确保网络和系统的安全性，从而保护重要信息不受威胁。