Java 和 C# 有许多相似之处，但它们也有一些重要的不同之处，其中最大的不同可能是：

1. 开发平台不同：Java 可以在多个操作系统上运行，包括 Windows、Linux、macOS 等，而 C# 更多地被用于 Windows 平台开发。

2. 编程语言性质不同：Java 是一种面向对象的、解释型语言，而 C# 更多地是一种面向对象的、编译型语言。

3. 自由软件支持不同：Java 被认为是一种自由软件（open-source software），因此在编写开源软件时很受欢迎。而 C# 的开源实现 Mono 并没有得到与 Java 相同的支持。

4. 委托机制不同：在 C# 中，委托是重要的编程机制，对于多线程编程非常有用，而 Java 中则没有直接对应的机制。

总之，Java 和 C# 都是非常强大的编程语言，开发者可以根据自己的需求和技能水平选择其中之一。