1.了解项目架构：

了解项目的整体架构，包括MVC架构，分层架构等。需要了解哪些类属于哪一层，各层之间的关系等。

2.了解项目的流程：

了解项目的业务流程，明确各个模块之间 的交互规则。

3.分析项目中使用的框架：

针对项目使用的框架，比如Spring、MyBatis等，深入了解其源码及其原理，以便能够更好地应用它们。

4.深入理解项目中使用的设计模式：

针对项目中使用的各种设计模式，比如工厂模式、代理模式等，深入理解其实现原理和使用方式，以便能够在项目中更好地运用它们。

5.阅读代码：

阅读项目代码，在代码中寻找关键的类和方法。学习这些类和方法的功能和用处。

6.实践：

实践是最好的学习方式，通过自己编写代码，模拟项目中的场景，再将自己的代码与项目中的代码进行比对和学习，进一步加深对项目的理解。

7.与他人交流：

可以找其他人交流，了解他们是如何看待这个项目，有哪些不同的视角和想法。

8.参与开源项目：

参与开源项目也是很好的学习方式，可以了解更多现代化开发中设计思想和技术栈，接触优秀的实践者和思想领袖。

总之，要想彻底理解一个Java项目，需要综合运用以上这些方法，不断加深自己对项目的理解。